本院は、特定非営利活動法人「女性医師のキャリア形成・維持・向上をめざす会」（ejnet)が行う「働きやすい病院評価」の認証を平成19年3月11日に取得しました。全国の大学病院では初めてであり、全病院を通しても全国で６番目の認証取得です。
　この事業は、「女性医師・すべての医療従事者が安心して働くことができる病院」という観点からejnetが第三者確認を行い、病院の「働きやすさ」を評価・認定することにより、わが国における「働きやすい病院」のインフラ整備が着実に実現されていくことを目指して実施されているものです。

　本院は、平成19年2月23日に全国の大学病院では２番目となる「プライバシーマーク（ＪＩＳＱ15001）を取得しています。
「プラバシーマーク（ＪＩＳＱ15001）とは、事業者が個人情報保護の取り扱いを適切に行う体制を整備していることを証明するものです。

　島根大学出雲キャンパスでは、2008年3月14日に、ISO14001の拡大認証登録を取得しました。国立大学法人で附属病院を含む認証は全国で初めてです。

　本院は、平成20年3月17日付けで、財団法人日本医療評価機構から病院機能評価の認定（病院種別「一般病院」）を取得しています。
　病院機能評価とは、（財）日本医療評価機構による第三者評価で、病院の現状と問題点を明確にし、基準を満たした病院に認定証が発行されるものです。

　本院は、特定非営利活動法人「卒後臨床研修評価機構」が行う「卒後臨床研修評価」の認証を取得し、平成23年3月1日認定書の交付を受けました。
　この事業は、臨床研修プログラムを中心とした第三者による臨床研修評価を行い、医療の発展に寄与するとともに、臨床研修病院群の質の向上を図ることを目的として実施されているものです。